O Convento situa-se na àrea peri-urbana da cidade de Évora, a cerca de 1.5Km, surgindo isolado num vale entre as colinas de Évora e São Bento de Castris, em zona preponderantemente hortícola. Na proximidade localiza-se o Forte de Santo António e o Aqueduto da Prata.

O complexo monástico desenvolve-se num espaço murado, cujo interior compreende um conjunto de espaços como hortos, hortas, laranjais e áreas agrícolas, que se interligam por forma a fazer prevalecer a vida solitária, o recolhimento, a penitência, a espiritualidade e a epifania dos monges que nele habitam, de acordo com os princípios da ordem e com as imposições biofísicas matriciais do sítio em que foi erguido. No recinto do Convento foi recriado, um deserto real que se metamorfoseia no laranjal do claustro grande, o hortus communis e ainda na intimidade do desertum individual de cada anacoreta, o pequeno jardim individual, o hortulum, das celas. No primeiro recinto o monge deambula, o segundo requer estudo e oração. No vasto e monótono claustro, o laranjal instala-se nos quatro canteiros determinados por uma geometria ortogonal, centrada numa taça de água, também ela de planta octogonal, invocando o vazio e o silêncio, analogamente a solidão do deserto, tanto pela sua fisionomia como pela métrica da plantação, reforçada ainda pela perenidade que a caracteriza. O centro geométrico da composição é reforçado por um círculo de ciprestes, que num discurso simbólico invocam a união entre o céu e a terra. O hortulum individualiza-se também pelo elenco vegetal que o compõe, reflexo do carácter e da cultura do monge que nele se enclausura. A vasta área de produção, a Quinta de Santa Maria Scale Coeli, mundo das coisas mais terrenas, localiza-se entre o muro que confina a propriedade e o recinto de clausura. Compreende uma horta murada de pequenas dimensões, que se rege pela sua auto-suficiência, sendo a restante área ocupada por pastagem destinada ao gado vacum, outrora ovino. A Quinta evoca igualmente o desertum; é dentro do mundo selvático, no deserto-mata que se produz, protege, isola, cerca e defende o mundo espiritual do profano. Na Quinta os monges realizam os passeios de Domingo e dias de festa. O sistema hidráulico da Cerca era constituído por dois sistemas independentes, o principal de captação de água do Aqueduto da Água de Prata, os outros, de captação num poço, localizado a S. do mosteiro, equipado com nora de eixo alto. Com o exterior o contacto é visual, lê-se a silhueta de Évora, e distingue-se o traçado do Aqueduto da Água de Prata. Do exterior, os oito ciprestes do laranjal e os quatro que pontuam o quadrado que define o cemitério dos padres, são a única referência da composição deste universo.(monumentos, 2014)